Образован из бывшего 2-го участка Веденского округа Постановлением Чечоблисполкома 30 марта 1923 года.
Указом Президиума Верховного Совета СССР 7 марта 1944 года Чечено-Ингушская АССР упраздняется, территория Ножай-Юртовского района передана в состав Дагестанской АССР.
Указом Президиума Верховного Совета РСФСР 9 января 1957 года восстановлена Чечено-Ингушская АССР, Ножай-Юртовский район вошел в состав республики из состава Дагестанской АССР под названием Андалалский.
Указом Президиума Верховного Совета РСФСР 10 апреля 1957 года Андалалский район переименован в Ножай-Юртовский, село Андалалы - в село Ножай-Юрт.
На территории района есть места, связанные с историческими событиями и почитаемые жителями.